Septoriose : comment l'identifier et la traiter

Dernière mise à jour : octobre 2026

La septoriose est une maladie fongique, causée sur la tomate par Septoria lycopersici, qui produit de nombreuses petites taches circulaires à centre gris ou beige, à bordure sombre et parsemées de minuscules pycnides noires. Elle commence sur les feuilles les plus basses et progresse vers le haut avec les éclaboussures d'eau. Retirez tôt les feuilles basses atteintes, paillez, passez à l'irrigation goutte à goutte, améliorez l'aération, pratiquez la rotation et protégez la canopée restante pendant les périodes humides.

Quelle est la cause de la septoriose ?

Les champignons du genre Septoria infectent les feuilles (et parfois les tiges), produisant de petites taches caractéristiques à centre gris ou beige, ponctuées de minuscules fructifications noires. Ils survivent dans les débris et sur les semences, se propagent par éclaboussures et sont favorisés par une humectation prolongée du feuillage.

À quoi ressemble la septoriose ?

• Nombreuses petites taches circulaires (2–5 mm) à centre beige pâle ou gris et à bordure plus sombre.
• Minuscules pycnides noires (fructifications) parsemant le centre des taches : un signe diagnostique à la loupe.
• Les feuilles basses et âgées sont touchées en premier ; elles jaunissent et tombent à mesure que la maladie progresse vers le haut.
• Défoliation importante exposant les fruits aux coups de soleil dans les cas graves.

Comment la septoriose se propage-t-elle ?

Survit dans les débris de culture et sur les semences ; les spores sont projetées sur les feuilles basses par les éclaboussures de pluie et l'irrigation par aspersion, puis progressent dans la canopée au fil des cycles humides répétés.

Quelles conditions favorisent la septoriose ?

Temps chaud, pluvieux et humide ; humectation prolongée du feuillage ; canopées denses et irrigation provoquant des éclaboussures ; inoculum résiduel dans les débris.

Quels dégâts la septoriose provoque-t-elle ?

La défoliation progressive réduit la photosynthèse et le rendement, affaiblit les plantes et expose les fruits aux coups de soleil ; chez les céréales, la septoriose foliaire réduit le remplissage du grain.

Comment surveiller la septoriose ?

Inspectez les feuilles basses pendant les périodes chaudes et humides ; confirmez à la loupe (recherchez des pycnides noires dans les taches) ; intervenez en préventif dès que les conditions sont favorables à la maladie.

Comment lutter contre la septoriose ?

1. Améliorez l'aération, évitez de mouiller le feuillage par aspersion, éliminez les débris et pratiquez la rotation ;
2. appliquez des programmes de protection en préventif et aux premiers symptômes, en commençant par le bas de la canopée.

Comment traiter la septoriose ?

• Retirez tôt les feuilles basses atteintes. La maladie commence sur le feuillage le plus âgé et le plus bas ; supprimer ces feuilles au cours de la première ou des deux premières semaines élimine la rampe de lancement et fait gagner des semaines.
• Paillez la surface du sol. Un paillage de paille ou de plastique bloque physiquement les spores projetées depuis le sol et les débris contaminés, et c'est l'une des mesures les plus rentables disponibles.
• Cessez de mouiller les feuilles. Préférez l'irrigation goutte à goutte à l'aspersion, et arrosez tôt dans la journée. La pluie, vous ne pouvez pas la maîtriser ; l'irrigation, si.
• Espacez et tuteurez pour favoriser l'aération. Les plantes palissées et taillées sèchent plus vite ; les plantes étalées restent humides et perdent le bas de leur canopée.
• Protégez la canopée restante pendant les périodes humides et renouvelez après la pluie : les applications sont préventives et ne peuvent pas guérir une tache existante.
• Éliminez les débris et pratiquez la rotation. Septoria lycopersici hiverne sur les débris de tomate et sur des adventices solanacées comme la morelle noire et la morelle de Caroline ; une interruption de deux à trois ans sans solanacées, associée à la lutte contre les adventices, réduit l'inoculum de départ.
• Ne travaillez pas dans une culture mouillée. Les mains, les vêtements et les outils déplacent les spores le long du rang aussi efficacement que la pluie.

La septoriose progresse du bas de la plante vers le haut, propagée par les éclaboussures d'eau. Presque toutes les mesures efficaces interrompent les éclaboussures ou éliminent l'inoculum des feuilles basses à partir duquel elle démarre.

La défoliation est le véritable coût. Les taches elles-mêmes comptent bien moins que la perte de la canopée qui devrait faire grossir et protéger les fruits : sur une plante défoliée, les fruits prennent des coups de soleil et restent petits.

Septoriose, alternariose ou tache bactérienne ?

• Septoriose : nombreuses petites taches circulaires de 2–3 mm, avec un centre gris ou beige et une bordure sombre bien marqués, et de minuscules fructifications noires en tête d'épingle (pycnides) visibles dans ce centre pâle. Touche rarement les fruits.
• Alternariose : lésions moins nombreuses, plus grandes et plus sombres, avec des anneaux concentriques (le motif en cible), souvent entourées d'un halo jaune ; elle attaque les tiges et les fruits aussi bien que les feuilles.
• Tache et moucheture bactériennes : lésions plus petites, anguleuses, d'aspect détrempé et graisseux, souvent avec un halo jaune ; elles atteignent bien les fruits, avec des taches galeuses en relief.
• Mildiou (Phytophthora infestans) : grandes plages irrégulières gris-vert d'aspect graisseux qui s'étendent rapidement par temps frais et humide, avec une sporulation blanche en bordure de lésion sur la face inférieure ; une maladie beaucoup plus rapide et plus destructrice.

Toutes trois commencent sur les feuilles basses d'une culture de tomates par temps humide, et on les confond couramment. Observez chaque lésion à la loupe.

Les pycnides noires en tête d'épingle dans un centre pâle confirment la septoriose. Voir Alternariose, Tache et moucheture bactériennes et Mildiou (Phytophthora infestans).

Pourquoi la septoriose commence-t-elle toujours par le bas de la plante ?

Ce schéma est diagnostique et il vous indique où intervenir. L'inoculum hiverne dans les débris et à la surface du sol, et il est remonté par les éclaboussures de pluie et d'irrigation. Les feuilles les plus basses sont donc infectées en premier, et chaque nouvel épisode pluvieux fait remonter le front un peu plus haut sur la plante.

Cette géométrie explique pourquoi le paillage et la suppression des feuilles basses sont ici d'une efficacité disproportionnée par rapport à une maladie disséminée par le vent, et pourquoi une application à mi-hauteur de la canopée qui néglige le bas de la plante tend à décevoir. Cela signifie aussi que la maladie est prévisible : si vous savez qu'elle était présente l'an dernier et que la parcelle n'est pas paillée, vous savez où elle apparaîtra et à peu près quand.

Quand vaut-il la peine de traiter la septoriose ?

• Intervenez : saison humide à venir, lésions sur les feuilles basses, culture encore en nouaison ou en grossissement des fruits, variété indéterminée avec encore des semaines de récolte
• Probablement inutile : dernière récolte imminente, temps sec annoncé, dégâts limités à des feuilles déjà en sénescence
• Misez plutôt sur la prévention la saison prochaine : la parcelle a eu de la septoriose cette année et n'est pas paillée ; le paillage et la rotation feront plus que n'importe quelle application en cours de saison

La septoriose tue rarement une plante ; la décision est donc économique plutôt qu'existentielle, et elle dépend d'une seule chose : la quantité de canopée dont la culture a encore besoin. Une infection précoce sur une culture qui n'a pas encore noué et grossi ses fruits justifie une intervention, car les feuilles perdues sont celles qui auraient rempli ces fruits. Le même niveau d'infection sur une culture déterminée qui termine déjà sa dernière récolte ne la justifie généralement pas.

Le seuil pratique que la plupart des producteurs peuvent appliquer est le tiers inférieur de la canopée. Une fois les lésions installées à ce niveau et si le temps reste humide, la maladie continuera de progresser vers le haut, et une intervention visant à protéger le milieu et le haut de la canopée est justifiée. Attendre que le milieu de la canopée soit atteint revient à accepter une récolte plus petite et plus sensible aux coups de soleil : sur une plante défoliée, les fruits n'ont plus d'ombre.

La septoriose de la tomate est-elle la même que celle du blé ?

Les recherches sur « septoria » mélangent deux maladies assez différentes, et la distinction compte si vous cultivez les deux. Cette page traite de Septoria lycopersici, l'agent pathogène responsable de la tache foliaire de la tomate. La septoriose du blé est causée par Zymoseptoria tritici, un agent pathogène différent, avec une autre gamme d'hôtes, une autre épidémiologie et, surtout, son propre profil de résistance aux fongicides, bien documenté.

Ils partagent l'historique du genre, la progression du bas vers le haut par dispersion par éclaboussures et les pycnides noires dans des lésions pâles, de sorte que les réflexes de diagnostic se transposent. Presque rien d'autre ne se transpose : un programme, un choix de produits ou une stratégie de gestion des résistances conçus pour l'un ne sont pas transposables à l'autre, et aucun des deux hôtes n'est une source d'inoculum pour l'autre.

Si votre culture est une céréale, l'agent pathogène concerné est Zymoseptoria tritici et les recommandations locales propres aux céréales s'appliquent. Nos programmes céréales sont accessibles depuis la page Blé.

Comment prévenir la septoriose la saison prochaine ?

Gestion de l'aération et de la canopée, irrigation goutte-à-goutte plutôt que par aspersion, élimination des débris végétaux, rotation et semences saines, ainsi que des pulvérisations préventives en période humide.

Les allégations et la disponibilité des produits varient selon les juridictions. Lisez et respectez toujours l'étiquette du produit.