Rhizoctonia (pourriture des racines et fonte des semis)

Dernière mise à jour : octobre 2026

De quoi s'agit-il ?

Rhizoctonia est un champignon du sol très répandu qui attaque les semis (fonte des semis), les tiges au niveau du sol (chancre), les racines et les tubercules, ainsi que le gazon (plaque brune). Il survit dans le sol et les débris et est favorisé par des conditions chaudes et modérément humides.

Comment l'identifier

• Semis qui s'effondrent avec des chancres déprimés brun rougeâtre au niveau du sol (fonte des semis en post-levée).
• Chancres déprimés sur tiges et racines et pourriture brune des racines ; sur pomme de terre, sclérotes sombres de « rhizoctone brun » sur les tubercules.
• Retard de croissance par foyers et peuplements irréguliers ; sur gazon, plaques brunes circulaires.
• Mycélium brun en forme de toile sur les tiges et le sol par temps humide.

Cycle de vie et propagation

Survit dans le sol et les débris sous forme de mycélium et de sclérotes ; infecte directement les semis, les tiges et les racines ; favorisé par les sols chauds et les résidus de culture ; se propage par la terre, les substrats et les outils contaminés.

Conditions favorables

Sols chauds et modérément humides ; résidus de culture ; sols compactés ou battants ; succession de cultures sensibles.

Dégâts et propagation

Tue les semis (pertes de peuplement), provoque des chancres sur les tiges et la pourriture des racines et des tubercules (ce qui réduit le rendement et la qualité de conservation) et endommage le gazon, avec l'impact le plus important à l'implantation.

Surveillance et observation

Surveillez la levée et la vigueur des semis ; examinez la base des tiges et les racines des plantes chétives ; évaluez les débris présents dans le sol et l'historique des zones à problème.

Comment le maîtriser

1. Utilisez des substrats propres et appliquez des mesures d'hygiène, gérez les résidus et l'humidité du sol, favorisez une zone racinaire saine et compétitive et appliquez des programmes de protection en préventif au stade semis.
2. Une pourriture installée est irréversible : misez sur la prévention et la protection des racines.

Comment gérer Rhizoctonia

• Ne comptez pas sur le seul drainage. Améliorer le drainage permet de gérer les oomycètes ; Rhizoctonia exige d'autres leviers. C'est l'idée reçue la plus répandue à son sujet.
• Semez dans un sol réchauffé, à la bonne profondeur. Un semis peu profond et une levée rapide raccourcissent la période de vulnérabilité ; un semis profond dans un sol frais la prolonge.
• Pratiquez la rotation avec des plantes non hôtes et sachez que R. solani comprend de nombreux groupes d'anastomose aux gammes d'hôtes différentes : une rotation efficace contre un groupe peut ne pas l'être contre un autre.
• Gérez les résidus. Le champignon survit sous forme de sclérotes et de mycélium sur les résidus de culture ; leur enfouissement et leur décomposition réduisent l'inoculum disponible pour la culture suivante.
• Évitez les blessures mécaniques lors de la plantation et des travaux du sol, car elles ouvrent des points d'infection à la base des tiges et sur les tubercules.
• Utilisez des substrats propres et pasteurisés et des plateaux désinfectés en multiplication, ainsi que des semences saines lorsque le pathogène est transmis par les semences.
• Développez l'activité biologique du sol. La colonisation compétitive de la rhizosphère par des organismes bénéfiques réduit la pression au fil du temps ; il s'agit d'une mesure de programme appliquée avant la culture, et non d'une solution de rattrapage.
• Retirez rapidement les plantes atteintes et le substrat qui les entoure en multiplication, car le champignon se propage de plante en plante par le substrat.

Rhizoctonia solani se distingue des oomycètes d'une manière importante en pratique : il n'a pas besoin d'un sol saturé. Il progresse dans le sol sous forme de mycélium au lieu de nager sous forme de zoospores ; il agit donc dans des conditions plus sèches et plus chaudes, là où Pythium et Phytophthora n'agissent pas · et un plateau sec ou un champ bien drainé ne protège pas contre lui.

Comme il se propage sous forme de mycélium dans le sol et le long des racines en contact, Rhizoctonia produit des foyers circulaires qui s'étendent dans les plateaux et les planches : un indice diagnostique utile, distinct des pertes dispersées dues à un problème physique ou de qualité des semences.

Les symptômes qu'il provoque, culture par culture

• Fonte des semis et tige en fil de fer : lésion ferme, sèche, sombre et déprimée à la base de la tige d'un semis ; la tige peut rester debout et se ratatiner au lieu de basculer, ce qui constitue la distinction « tige en fil de fer » par rapport à Pythium
• Rhizoctone brun de la pomme de terre : sclérotes noirs et durs collés à la peau des tubercules, impossibles à enlever au lavage ; il s'agit d'un déclassement esthétique, signe le plus visible de la maladie
• Chancre de la tige de la pomme de terre : lésions sombres sur les tiges souterraines et les stolons, entraînant la formation de tubercules aériens et l'enroulement des feuilles
• Pourriture des racines et du collet chez les haricots, les brassicacées, la betterave sucrière et de nombreux légumes
• Rhizoctone des céréales : lésions lenticulaires à bordure sombre à la base de la tige
• Plaque brune du gazon : plaques circulaires bordées d'un « anneau de fumée » plus sombre par temps chaud et humide
• Pourriture ventrale du concombre : lésions aux points de contact du fruit avec le sol contaminé

Le rhizoctone brun sur les tubercules est facile à diagnostiquer : les sclérotes sont impossibles à confondre. Les symptômes sur semis et sur racines se confondent bien plus facilement avec ceux d'autres pathogènes.

Rhizoctonia ou Pythium ?

• Humidité : Pythium a besoin d'un substrat saturé ; Rhizoctonia agit dans des conditions plus sèches et plus chaudes
• Lésion : Pythium provoque un étranglement mou, imbibé d'eau et spongieux au niveau du sol ; Rhizoctonia provoque une lésion ferme, sèche, déprimée et brun foncé
• Racines : les racines atteintes par Pythium se ramollissent et leur tissu externe se détache, ne laissant qu'un fil nu ; celles atteintes par Rhizoctonia présentent des lésions brunes distinctes, avec des tissus intacts
• Mycélium : Rhizoctonia présente souvent un mycélium brun, grossier et clairsemé au niveau de la lésion, formant parfois une toile à la surface du substrat ; Pythium n'en présente aucun de visible
• Répartition : tous deux progressent par foyers ; les foyers de Rhizoctonia ont souvent un bord plus net
• Produits : les substances spécifiques des oomycètes agissent sur Pythium et n'ont aucun effet sur Rhizoctonia, et inversement

Ces deux pathogènes forment le couple le plus souvent confondu en multiplication et, comme leur chimie diffère (l'un est un vrai champignon, l'autre un oomycète), une erreur fait perdre un traitement.

Voir Pythium et fonte des semis et Fonte des semis. Humide et spongieux : c'est Pythium ; sec et ferme : c'est Rhizoctonia.

Pourquoi les groupes d'anastomose comptent pour la rotation

Rhizoctonia solani n'est pas un pathogène unique et uniforme, mais un complexe de groupes génétiquement distincts, appelés par convention groupes d'anastomose (AG). Chacun possède sa propre gamme d'hôtes et sa propre expression de la maladie, ce qui détermine directement l'efficacité d'une rotation.

L'AG-3 est surtout associé à la pomme de terre, sur laquelle il provoque le rhizoctone brun et le chancre de la tige. Les groupes AG-2 touchent les brassicacées, la betterave sucrière et le gazon. L'AG-4 possède une large gamme d'hôtes parmi les légumes et les grandes cultures et est un agent fréquent de fonte des semis. L'AG-1 provoque des brûlures foliaires sur le riz, le soja et les haricots.

Par conséquent, un producteur qui fait alterner la pomme de terre avec une culture attaquée par un autre AG n'a pas échappé à Rhizoctonia · il a simplement changé le groupe favorisé. Lorsque la maladie persiste malgré une rotation apparemment judicieuse, c'est l'identification du groupe qui l'explique, et cette question relève du laboratoire plutôt que du champ.

C'est aussi pourquoi les conseils généraux sur la rotation contre Rhizoctonia sont particulièrement vagues dans la littérature : la bonne rotation dépend du groupe présent, qui varie d'une parcelle à l'autre.

Le prévenir la saison prochaine

Substrats et outils propres, gestion des résidus et de l'humidité, biologie du sol saine et compétitive, rotation et protection préventive à l'implantation.

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