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La brûlure bactérienne du riz est causée par Xanthomonas oryzae pv. oryzae, une bactérie qui vit à l'intérieur du xylème ; aucune solution chimique accessible aux producteurs ne guérit donc la maladie une fois la bactérie à l'intérieur. Recherchez des lésions foliaires à bord ondulé, des tissus opaques et un exsudat laiteux, ou le kresek, un flétrissement des jeunes plants dans les trois premières semaines après le repiquage. Confirmez par le test d'exsudation sur tige coupée, puis gérez la maladie grâce à des semences saines, à la gestion de l'eau et de l'azote, et aux gènes de résistance.
Cultures concernées
De quoi s'agit-il ?
Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) est une bactérie en bâtonnet, à pigmentation jaune, qui colonise les vaisseaux du xylème du riz. L'infection commence lorsque des cellules bactériennes présentes dans un film d'eau sont aspirées dans les hydathodes (les pores aquifères situés le long du bord de la feuille, qui exsudent des gouttelettes de guttation pendant la nuit) ou sont introduites dans la plante par des blessures. À partir du point d'entrée, la population progresse le long des faisceaux vasculaires, et la lésion classique est la trace visible de ce déplacement.
Le même organisme produit trois maladies cliniquement différentes selon l'âge de la plante et la voie d'entrée. La brûlure foliaire est la forme familière sur les plantes établies. Le kresek est un flétrissement systémique des jeunes plants qui fait suite à des lésions racinaires au repiquage. La feuille jaune pâle est une forme systémique chronique dans laquelle le symptôme visible apparaît loin de l'endroit où se trouve réellement la bactérie. Les producteurs qui ne connaissent que la première forme diagnostiquent régulièrement mal les deux autres.
La brûlure bactérienne classique n'est pas établie dans la production rizicole des États-Unis. C'est une contrainte majeure de la riziculture de bas-fonds, irriguée et pluviale, en Asie du Sud et du Sud-Est, et elle est présente dans certaines régions d'Afrique, d'Australie et d'Amérique latine. La perte de rendement dépend entièrement de la précocité de l'infection : une brûlure foliaire tardive réduit le remplissage des grains, tandis que le kresek dans les trois premières semaines après le repiquage peut anéantir le peuplement.
Comment identifier la brûlure bactérienne du riz ?
La brûlure foliaire commence à l'extrémité de la feuille ou le long d'un bord sous forme de strie d'aspect huileux, puis jaunit et devient enfin blanc paille à mesure que les tissus meurent. Le critère visuel le plus utile est le bord de la lésion en progression : il est ondulé et sinueux, et non rectiligne. À contre-jour, les tissus atteints sont opaques, et non translucides. Par matinées humides, la lésion laisse s'écouler un exsudat bactérien laiteux qui sèche en une fine croûte jaune ou en petites perles ambrées à la surface de la feuille.
Le kresek est le syndrome des jeunes plants et il ne ressemble en rien à la brûlure foliaire. Il apparaît dans les trois premières semaines après le repiquage. Les feuilles s'enroulent, virent au vert grisâtre, puis à la couleur paille, et des poquets entiers flétrissent et meurent. Il n'y a aucune lésion marginale à rechercher, car la bactérie est entrée par les racines coupées lors de l'arrachage et du repiquage et a gagné directement le système vasculaire. Le kresek se comprend au mieux comme une maladie liée aux blessures de repiquage, et c'est le syndrome qui détruit les peuplements au lieu de simplement réduire le rendement.
La feuille jaune pâle est le piège. La plus jeune feuille complètement déployée devient uniformément jaune pâle, ou porte une large bande pâle, tandis que les feuilles plus âgées restent vertes. La bactérie se trouve dans le collet et l'entre-nœud : elle n'est pas dans les tissus jaunes. L'échantillonnage de la feuille décolorée donne un résultat négatif et le producteur conclut à une carence nutritionnelle. Échantillonnez plutôt le collet et l'entre-nœud inférieur.
Le test de confirmation au champ est le test d'exsudation sur tige coupée. Coupez net une talle ou une gaine foliaire présentant des symptômes, plongez l'extrémité coupée dans un verre d'eau claire et observez-la sur un fond sombre, sous un bon éclairage. Un résultat positif se traduit par des filaments laiteux, denses et troubles s'écoulant des faisceaux vasculaires sectionnés en une minute ou deux. Ce flux est une masse de cellules bactériennes quittant le xylème, et aucun problème fongique ou abiotique ne le reproduit.
Quelles autres affections ressemblent à la brûlure bactérienne du riz ?
Les stries bactériennes des feuilles, causées par X. oryzae pv. oryzicola, sont la maladie la plus ressemblante et celle qui est le plus souvent confondue. Leur agent pénètre par les stomates plutôt que par les hydathodes et colonise le parenchyme plutôt que le système vasculaire. Leurs lésions commencent donc n'importe où sur le limbe plutôt qu'au bord, sont internervaires avec des bords rectilignes, étroits et parallèles, et paraissent translucides à contre-jour. Les stries ne font jamais flétrir la plante, car la bactérie n'est pas dans le système de conduction. Bord ondulé, tissus opaques et exsudation signifient brûlure bactérienne ; bords rectilignes, tissus translucides et absence de flétrissement signifient stries.
Le dessèchement de l'extrémité des feuilles dû à la salinité ou à une carence en potassium ressemble de loin à la brûlure bactérienne. Il est uniforme et symétrique sur l'ensemble de la culture, suit un gradient dans la parcelle au lieu d'apparaître sur des poquets dispersés, ne présente pas de bord ondulé et ne donne aucune exsudation au test. Les dégâts mécaniques à l'extrémité dus à la coupe des jeunes plants avant le repiquage produisent une ligne de coupe rectiligne avec un brunissement en dessous.
La brûlure de la gaine produit des lésions irrégulières vert grisâtre à bordure brune sur les gaines près de la ligne d'eau, avec un mycélium et des sclérotes visibles ; la pyriculariose du collet produit une bande sombre et étranglée au niveau du collet de la feuille. Ni l'une ni l'autre ne donne d'exsudation.
Comment la brûlure bactérienne du riz se propage-t-elle ?
Xoo survit entre les cultures dans les chaumes et la paille de riz, dans les repousses et les plantes spontanées, dans les graminées adventices le long des diguettes et des canaux, sur et dans les semences, ainsi que dans l'eau d'irrigation elle-même. L'eau d'irrigation est un véritable vecteur, et non un vecteur théorique : les bactéries libérées par les débris infectés en amont sont transportées vers des parcelles saines, et l'eau de submersion stagnante les maintient en contact avec la culture.
L'infection des plantes établies se fait par les hydathodes lorsqu'un film d'eau recouvre le bord de la feuille : guttation nocturne, rosée, pluie ou éclaboussures dues à la submersion. Une fois à l'intérieur, la bactérie se multiplie dans les vaisseaux du xylème et se déplace de façon systémique. L'exsudat expulsé de la lésion le matin constitue l'inoculum du cycle suivant, redistribué par la pluie, la pluie poussée par le vent et le frottement des feuilles entre elles dans une canopée dense.
La voie du kresek contourne tout cela. L'arrachage des jeunes plants en pépinière déchire les racines ; le repiquage enfonce ces racines coupées dans une eau qui transporte la bactérie. Chaque racine coupée est un point d'entrée vasculaire ouvert. C'est pourquoi le kresek se concentre sur les trois premières semaines, et pourquoi les pratiques de pépinière et de repiquage comptent plus que tout traitement pulvérisé par la suite.
Les typhons et les violentes tempêtes sont le moteur classique des épidémies. Ils blessent l'ensemble de la canopée, dispersent l'inoculum dans la parcelle et laissent de l'eau stagnante. Une épidémie de brûlure bactérienne en Asie peut très souvent se lire comme la trace d'une tempête survenue deux à trois semaines plus tôt.
Quelles conditions favorisent la brûlure bactérienne du riz ?
La maladie se nourrit de chaleur, d'eau et d'azote. La plage favorable est d'environ 25–34 °C, avec une humidité élevée. En dessous, la progression ralentit fortement ; au-dessus, la culture a généralement dépassé le stade sensible.
Une submersion profonde et une lame d'eau stagnante en permanence aggravent la maladie. La hauteur d'eau augmente l'humidité dans la canopée, maintient les bords des feuilles mouillés et transporte l'inoculum entre les poquets. Les cycles de drainage qui laissent la surface du sol sécher entre les irrigations la réduisent de façon mesurable ; c'est pourquoi la gestion de l'eau est une pratique de lutte et non un détail agronomique.
Un apport élevé d'azote, en particulier un apport unique important, produit des tissus tendres et succulents et une canopée dense qui reste mouillée plus longtemps. Fractionner l'azote et réduire la dose totale sur les parcelles sujettes à la brûlure bactérienne est l'un des rares leviers efficaces en cours de saison.
Tout ce qui blesse la plante est un facteur de risque : tempêtes, dégâts mécaniques, dégâts d'alimentation des insectes et, surtout, lésions racinaires au repiquage.
Quels dégâts la brûlure bactérienne cause-t-elle chez le riz ?
La brûlure foliaire détruit la surface photosynthétique pendant le remplissage des grains. Les pertes augmentent avec la part de feuille paniculaire et d'avant-dernière feuille perdue et avec la précocité de cette perte ; une brûlure qui survient à l'épiaison coûte bien plus cher qu'une brûlure en fin de stade pâteux.
Le kresek tue les plantes purement et simplement. Comme il frappe dans les trois semaines suivant le repiquage, la culture n'a pas le temps de compenser, et la perte est une perte de peuplement plutôt qu'une baisse de rendement. Regarnir les manques dans une parcelle infestée est rarement rentable.
La feuille jaune pâle réduit de façon chronique la vigueur et le remplissage des grains, et elle est souvent imputée à un problème nutritionnel : son coût est donc systématiquement sous-estimé.
La propagation d'une parcelle à l'autre passe par l'eau et par les déplacements humains. Les canaux d'irrigation transportent la bactérie entre les parcelles d'un même réseau ; les outils, les machines, les mains et les bottes la déplacent au sein d'une parcelle ; et les semences la transportent d'une saison et d'une région à l'autre.
Comment dépister la brûlure bactérienne du riz ?
Commencez le dépistage en pépinière, pas au champ. Les symptômes en pépinière et des antécédents de brûlure bactérienne dans la parcelle d'origine prédisent mieux le kresek que tout ce qui est observé après le repiquage.
Pendant les trois premières semaines après le repiquage, parcourez la parcelle à la recherche de poquets qui flétrissent plutôt que de lésions foliaires. Des feuilles enroulées vert grisâtre sur de jeunes plantes justifient un test d'exsudation immédiat.
À partir du tallage, inspectez les bords des feuilles tôt le matin, lorsque l'exsudat est encore visible et que les gouttelettes de guttation ne se sont pas encore évaporées. Contrôlez les bordures situées au vent et toute partie de la parcelle restée submergée le plus longtemps.
Confirmez chaque cas suspect par le test d'exsudation sur tige coupée avant d'agir et, lorsque le symptôme est la feuille jaune pâle, prélevez l'échantillon sur le collet et l'entre-nœud plutôt que sur le limbe décoloré. Une confirmation en laboratoire est utile lors d'une première apparition dans un district, car la réponse de gestion diffère entre la brûlure bactérienne et les stries bactériennes.
Les pulvérisations permettent-elles de lutter contre la brûlure bactérienne du riz ?
Il n'existe aucune solution chimique curative contre la brûlure bactérienne. C'est le fait opérationnel le plus important de cette page, et la plupart des dépenses inutiles viennent de ce qu'on l'ignore.
Les fongicides sont sans effet. Xoo est une bactérie ; les familles chimiques de fongicides utilisées contre la pyriculariose et la brûlure de la gaine n'ont aucune activité sur elle, et les appliquer contre la brûlure bactérienne coûte de l'argent et retarde les véritables mesures.
Le cuivre n'est qu'un protectant de surface. Il ne peut pas atteindre une bactérie déjà présente dans les vaisseaux du xylème, et Xoo est tolérant au cuivre à un degré diagnostique : la résistance au nitrate de cuivre à 0,001 % sert de caractère d'identification de l'organisme. Le cuivre ne devrait pas être présenté à un producteur de riz comme une solution contre la brûlure bactérienne.
Les antibiotiques ne sont pas une option et, dans la plupart des juridictions, ils ne sont pas autorisés. L'Inde a imposé une interdiction totale de la streptomycine et de la tétracycline en agriculture à compter du 1 janvier 2024 ; l'UE et le Royaume-Uni n'autorisent pas les antibiotiques comme substances actives pesticides. Vérifiez les règles applicables là où vous exploitez, et attendez-vous à ce qu'elles interdisent cette voie.
Restent la génétique, l'hygiène et l'eau. Plus de quarante gènes de résistance Xa sont décrits, et une protection durable provient du pyramidage plutôt que d'un gène unique : les combinaisons construites autour de xa5, xa13, Xa21, Xa7 et Xa23 sont celles déployées en pratique. Une réserve compte énormément dans les systèmes sujets au kresek : Xa21 confère une résistance au stade adulte, de sorte qu'une combinaison pyramidée qui repose sur lui ne protégera pas les jeunes plants contre le kresek. Adaptez la combinaison de gènes au syndrome que vous rencontrez réellement.
Comment gérer la brûlure bactérienne du riz ?
Partez de semences certifiées saines et, là où l'installation existe, pratiquez le traitement des semences à l'eau chaude. Les semences sont la voie par laquelle la brûlure bactérienne arrive dans un district qui en était indemne.
Ne coupez pas l'extrémité des feuilles des jeunes plants. Cette coupe se fait par commodité de manipulation, et elle ouvre les faisceaux vasculaires exactement au niveau des tissus d'entrée, sur chaque plant, avec une seule lame. Si la lame passe par un plant infecté, elle inocule le reste du plateau.
Manipulez les jeunes plants de façon à limiter les déchirures de racines, et repiquez dans des parcelles drainées et séchées plutôt que dans une eau stagnante chargée de débris de la culture précédente.
Gérez l'eau activement. Drainez et laissez sécher entre les irrigations lorsque le système le permet, évitez les submersions inutilement profondes, et empêchez l'eau des blocs les plus touchés d'atteindre les blocs sains.
Réduisez l'azote total sur les parcelles sujettes à la brûlure bactérienne et fractionnez le reste. Évitez les apports d'azote importants avant une période de tempêtes annoncée.
Supprimez le réservoir entre les cultures : enfouissez ou retirez les chaumes et la paille, détruisez les repousses et les plantes spontanées, et maîtrisez les graminées adventices sur les diguettes et les berges des canaux.
Désinfectez les outils et le matériel entre les parcelles, et considérez l'eau d'irrigation comme un vecteur lorsque vous planifiez l'ordre dans lequel les blocs sont travaillés.
Pourquoi la fenêtre du kresek décide-t-elle de la saison ?
La brûlure bactérienne est généralement présentée comme une maladie foliaire, mais les pertes qui ruinent une saison sont concentrées dans une fenêtre de trois semaines juste après le repiquage, et cette fenêtre est créée presque entièrement par les pratiques agricoles plutôt que par la météo.
Voyez ce qui se passe pendant ces trois semaines. Les jeunes plants sont arrachés, ce qui déchire les racines. Leur extrémité peut être coupée, ce qui ouvre les faisceaux vasculaires. Ils sont ensuite placés dans une eau stagnante qui peut transporter des bactéries provenant des résidus de la culture précédente ou d'une parcelle située en amont. Chacune de ces étapes est une décision, et chacune est réversible.
À l'inverse, la phase de brûlure foliaire, plus tard dans la saison, est déterminée par les tempêtes, l'humidité et la densité de la canopée, des conditions sur lesquelles le producteur n'influe que partiellement, par la dose d'azote et la hauteur d'eau. La leçon est que la gestion la plus efficace de la brûlure bactérienne intervient avant que la culture ne ressemble à une culture, et qu'un producteur qui inspecte les bords des feuilles au stade gonflement a déjà dépassé la partie de la saison où les décisions comptaient le plus.
Cela explique aussi la réserve formulée plus haut sur les gènes de résistance. Une variété choisie pour une solide combinaison de gènes de résistance au stade adulte peut mener une parcelle parfaitement à travers la phase de brûlure foliaire et perdre malgré tout des poquets à cause du kresek, car la protection arrive une fois la fenêtre de vulnérabilité refermée.
Comment distinguer les trois syndromes de la brûlure bactérienne ?
| Syndrome | Période d'apparition | Ce que vous observez | Où prélever |
|---|---|---|---|
| Brûlure foliaire | Du tallage au remplissage des grains | Strie d'aspect détrempé partant de l'extrémité ou du bord de la feuille, virant au jaune puis au blanc paille ; bord ondulé ; tissu opaque à la lumière ; exsudat laiteux séchant en une croûte jaune | Front d'avancée de la lésion |
| Kresek | Les 3 premières semaines après le repiquage | Flétrissement de plantules entières ; les feuilles s'enroulent et virent au vert grisâtre puis à la couleur paille ; pas de lésion marginale ; la bactérie est entrée par les racines sectionnées | Base de la talle |
| Feuille jaune pâle | Milieu de saison, chronique | Feuille la plus jeune uniformément jaune pâle ou portant une large bande pâle ; les feuilles plus âgées restent vertes ; souvent confondue avec une carence nutritionnelle | Collet et entre-nœud · pas la feuille jaune |
| Strie bactérienne des feuilles (agent pathogène différent) | Tout stade | Lésions internervaires étroites, à bords rectilignes, n'importe où sur le limbe ; translucides à la lumière ; la plante ne flétrit jamais | Lésion, pour confirmation en laboratoire |
| Brûlure des extrémités due à la salinité ou au potassium (abiotique) | Tout stade | Dessèchement uniforme et symétrique des extrémités suivant un gradient dans la parcelle ; pas de bord ondulé ; pas d'exsudat ; test d'exsudation bactérienne négatif | Analyse de sol et analyse des tissus |
Solution Vegalab recommandée : Armour Boost
Gestion intégrée. La brûlure bactérienne est un problème sans remède curatif : les produits Vegalab jouent un rôle d'appoint dans un programme intégré (santé des plantes, prévention, soutien de la zone racinaire) et ne constituent ni un moyen de lutte ni un remède contre cette maladie. Les fondements sont des semences certifiées saines, l'absence de blessures aux racines et aux extrémités des plantules, le drainage et l'assèchement entre les irrigations, le fractionnement et la réduction de l'azote, l'élimination des chaumes et des repousses, et le choix d'une combinaison appropriée de gènes de résistance. Comme la bactérie se loge dans les vaisseaux du xylème, rien de ce qui est appliqué en surface ne l'atteint une fois l'infection installée ; tout ce qui suit se situe donc en amont de l'infection.
| Rôle | Produit | Utilisation |
|---|---|---|
| Résilience des plantes | Armour Boost | La silice pour des tissus résilients |
| Racines | Root Boost | Soutien de la zone racinaire pendant la phase d'installation après repiquage |
| Biologie du sol | Charge BioBoost | Soutien de la zone racinaire pour développer une biologie du sol suppressive |
Comment prévenir la brûlure bactérienne du riz la saison prochaine ?
La saison prochaine commence avec les résidus de celle-ci. Enfouissez ou retirez la paille et les chaumes, détruisez les repousses et les plantes spontanées, et débarrassez les diguettes et les berges des canaux des graminées adventices, car c'est là que Xoo passe l'hiver. Procurez-vous des semences certifiées saines et pratiquez le traitement à l'eau chaude là où il est disponible. Organisez la pépinière de façon à pouvoir arracher les plantules en déchirant le moins possible les racines et sans couper l'extrémité des feuilles. Prévoyez un programme azoté plus faible et davantage fractionné sur les parcelles ayant un historique de brûlure bactérienne. Vérifiez d'où provient votre eau d'irrigation et par quelles parcelles elle est passée, et organisez l'ordre des travaux de manière à intervenir en dernier dans les parcelles les plus touchées. Lorsque des gènes de résistance sont disponibles, choisissez une combinaison pyramidée plutôt qu'un gène unique, et vérifiez qu'elle couvre le stade plantule si votre problème est le kresek plutôt que la brûlure foliaire tardive.
À retenir
- La bactérie pénètre par les hydathodes situés en bordure de feuille, par les blessures et par les racines sectionnées lors du repiquage.
- Un seul agent pathogène provoque trois syndromes : brûlure foliaire, kresek et feuille jaune pâle.
- Une submersion profonde et une fumure azotée élevée aggravent la maladie ; le drainage et l'assèchement entre les irrigations la réduisent.
- Couper l'extrémité des plantules ouvre les faisceaux vasculaires de chacune d'elles et constitue un risque évitable.
- Xa21 confère une résistance au stade adulte ; une combinaison de gènes qui repose sur lui ne protège donc pas les plantules contre le kresek.
Les allégations et la disponibilité des produits varient selon les juridictions. Lisez et respectez toujours l'étiquette du produit.